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意根与五识和内外五尘的关系
首先来说，五识的生起和动转是由意根而来，意根若不作意和抉择，五识则不出现，意根作意和抉择之后五识和意识同时出现，在意根作意和触之处了别六尘。因此说五识的出现不是由意识决定的，而是由意根决定的，意识只是五识出生的必要条件之一，二者和合才能共同了别完整的尘境，其出现次第几乎不分前后，五识的出生和运转不由意识决定。
既然意根能决定五识的出生，那么为什么意根能主宰五识呢？我们知道，五识的出生必然是五根与五尘相触促成的，而五根与五尘相触是意根促成的结果。五根与五尘都是色法，不是识，不会主动互相触，再决定生五识，导致五根与五尘相触并且生五识的是意根。
意根为什么能导致五根触五尘呢？因为意根攀缘了六尘，想要仔细了别六尘。意根不是只攀缘法尘触法尘，而是攀缘整个尘境，完整的包括五尘的尘境，如果只攀缘法尘，不缘五尘，对于尘境的信息就不完整，就无法作抉择和选择，六识就不会出生。比如面前有五颜六色的鲜花，法尘和五尘和合起来是完整的鲜花样貌，如果意根不缘五尘，就不知道鲜花的色彩，那祂要如何决定触红花或者是蓝花、紫花？如何选择花？六识之所以有所选择地了别尘境，就是因为意根对尘境的抉择，其中一定少不了五尘境，五尘在六尘中所占比重是挺大挺重要的，而且还会先显现出来，容易识别，所以意根不会把六尘分开来缘，然后作抉择。
比如意根攀缘人相，不会只缘人的法尘相而剔除人的肤色和衣服的色彩相，而恰恰在最初是色彩最突出最吸引人，其次才是细的法尘相，对于其他尘境也是如此，所以意根是缘五尘的。在六尘进入胜义根之前的五尘境，意根当然也是能缘能作抉择的。比如在车祸发生之前，意根缘对面的车，知道马上要相撞了，于是紧急抉择躲避，如果意根只缘车的法尘，不缘车的五尘境，如何能知对面有车并且要相撞？如何能决定避开对面的车？在巨大的爆炸发生之前，意根如果不缘爆炸声音的五尘境，如何决定立即逃跑？
意根作了任何一个抉择之后，五识马上与意识生起去完成意根的指令，说明五识的出生是由意根决定的，是与意识一起听命于意根的。五识与意识在哪个尘境上了别，了别多长时间，重点了别哪些内容，都由意根指挥作主导。总而言之，意根是作主识，对五根、五尘和五识都能作主作决定，祂们之间是主动与被动的关系，是主导与服从的关系。
